Το ποδοσφαιρικό τμήμα της Μπεσίκτας ιδρύθηκε το 1911 όταν προσχώρησαν στον σύλλογο δύο τοπικές ποδοσφαιρικές ομάδες της περιοχής του Μπεσίκτας, η “Valideçeşme” και η “Basiret”.
Στην αρχή τα χρώματα της ομάδας ήταν το ερυθρόλευκα, αλλά το κόκκινο αντικαταστάθηκε απο το μαύρο ως ένδειξη πένθους για τις εδαφικές απώλειες της Τουρκίας στα Βαλκάνια κατά τους Βαλκανικούς Πολέμους.
Η Μπεσίκτας εκείνη την εποχή ήταν ο μόνος τουρκικός αθλητικός σύλλογος της χώρας για αυτό και αγωνίστηκε σε διάφορες αθλητικές διοργανώσεις ως αντιπροσωπευτικό συγκρότημα της χώρας.
Ως εκ τούτου η Μπεσίκτας είναι η μόνη τουρκική ομάδα που της επιτρέπεται να φέρει στο έμβλημά της την τουρκική σημαία.
Η ομάδα μεσουράνησε στο τουρκικό ποδόσφαιρο κατά την δεκαετία του ’40 και αυτό είχε ως επακόλουθο να αποκτήσει το προσωνύμιο Μαύροι Αετοί (Kara Kartallar), το οποίο καθιερώθηκε κατά τη διάρκεια ενός αγώνα το 1941 και απο τότε συνοδεύει την ομάδα της Κωνσταντινούπολης.
Η Μπεσίκτας παρουσίασε ανταγωνιστικές ομάδες και κατά τις δεκαετίες του ’50 και του ’60 όπως και στις αρχές της δεκαετίας του ’80 αλλά η η πιο επιτυχημένη περίοδος του συλλόγου είναι αναμφισβήτητα η δεκαετία του ’90 όταν έχοντας στην τεχνική της ηγεσία τον Άγγλο προπονητή Γκόρντον Μάιλν (Gordon Milne) πανηγύρισε την κατάκτηση 4 πρωταθλημάτων (3 από αυτά συνεχόμενα) και 3 κυπέλλων.
Η Μπεσίκτας συμμετείχε για πρώτη φορά στις ευρωπαϊκές διοργανώσεις το 1959 όταν και αντιμετώπισε σε διπλές αναμετρήσεις την Ρεάλ Μαδρίτης στα πλαίσια του Κυπέλλου Πρωταθλητριών.
Κατά καιρούς έχει βρεθεί αντιμέτωπη με μεγάλες ομάδες του ευρωπαϊκού στερεώματος όπως ο Άγιαξ, η Μπάγερν Μονάχου, η Λάτσιο, η Μίλαν, η Τσέλσι κ.α.
Έχει συμμετάσχει συνολικά 32 φορές στις ευρωπαϊκές διοργανώσεις απο τις οποίες οι 15 είναι στο Τσάμπιονς Λιγκ (58 αγώνες με 19 νίκες, 11 ισοπαλίες, 28 ήττες και τέρματα 56 υπέρ και 93 κατά ) , οι 11 στο Κύπελλο ΟΥΕΦΑ (52 αγώνες με 20 νίκες , 12 ισοπαλίες , 20 ήττες και τέρματα 76 υπέρ και 68 κατά και 7 στο Κύπελλο Κυπελλούχων (20 αγώνες με 4 νίκες,ισάριθμες ισοπαλίες, 12 ήττες και τέρματα 21 υπέρ και 38 κατά).
Οι μεγαλύτερες διακρίσεις του συλλόγου σε ευρωπαϊκό επίπεδο είναι η πρόκριση στα προημιτελικά του Κυπέλλου Πρωταθλητριών τη σεζόν 1986/87 και στα προημιτελικά του Κυπέλλου ΟΥΕΦΑ τη σεζόν 2002/03.
Η ευρύτερη νίκη της Μπεσίκτας είναι το 5-0 επί της FK Sarajevo στα πλαίσια του Κυπέλλου ΟΥΕΦΑ το 2002/03.
Άλλες σημαντικές νίκες είναι το 3-0 επί της Μπαρτσελόνα το 2001 στη φάση των ομίλων του Τσάμπιονς Λιγκ και η εκτός έδρας νίκη το 2002 επί της Τσέλσι στα πλαίσια της ίδιας διοργάνωσης.
Στον αντίποδα μελανή σελίδα στην ιστορία της Μπεσίκτας αποτελεί η ήττα-ρεκόρ με 8-0 απο την Λίβερπουλ την περίοδο 2007/08.
Έδρα της Μπεσίκτας είναι το Ισμέτ Ινονού Στάντιουμ το οποίο φέρει το όνομα του δεύτερου προέδρου της Τουρκικής Δημοκρατίας, Ισμέτ Ινονού, και εγκαινιάστηκε στις 19 Μαΐου του 1947.
Ο πρώτος αγώνας που διεξήχθη στο Ινονού ήταν φιλική αναμέτρηση μεταξύ της Μπεσίκτας και της σουηδικής ΑΪΚ Στοκχόλμης.
Το γήπεδο ανακατασκευάστηκε το 2004 με κυριότερες αλλαγές την αφαίρεση του στίβου και την επέκταση του αγωνιστικού χώρου, καθώς και της χωρητικότητας (32.086 θέσεις).
Το 2016 άνοιξε η νεα έδρα της Μπεσίκτας Vodofone Arena με 41.903 θέσεις.
Το γήπεδο βρίσκεται σε μια ιδιαίτερα εύπορη και όμορφη περιοχή του Μπεσίκτας.
Σε απόσταση λίγων εκατοντάδων μέτρων από τον Βόσπορο και το παλάτι Ντολμά Μπαχτσέ, δεσπόζει στη πλαγιά ενός δεντροφυτευμένου λόφου.
Είναι επίσης το μοναδικό γήπεδο στον κόσμο όπου ο θεατής έχει τη δυνατότητα να βλέπει δυο ηπείρους, την Ευρώπη και την Ασία.